Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms