Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usf1Q61069 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usf1Q61069 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usf1Q61069 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usf1Q61069 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usf1Q61069 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usf1Q61069 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usf1Q61069 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usf1Q61069 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usf1Q61069 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usf1Q61069 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usf1Q61069 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usf1Q61069 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms