Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms