Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprnQ60673 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms