Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3aQ60520 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms