Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms