Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tsr1Q5SWD9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tsr1Q5SWD9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tsr1Q5SWD9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tsr1Q5SWD9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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