Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Syne3Q4FZC9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Syne3Q4FZC9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Syne3Q4FZC9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Syne3Q4FZC9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Syne3Q4FZC9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Syne3Q4FZC9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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