Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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