Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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SbsponQ3UPR9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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