Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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