Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms