Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp19Q3UJD6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp19Q3UJD6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp19Q3UJD6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp19Q3UJD6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp19Q3UJD6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp19Q3UJD6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Usp19Q3UJD6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp19Q3UJD6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp19Q3UJD6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp19Q3UJD6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp19Q3UJD6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp19Q3UJD6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms