Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q3U6N9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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