Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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