Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cers3Q1A3B0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cers3Q1A3B0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms