Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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