Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam83bQ0VBM2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam83bQ0VBM2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms