Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms