Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms