Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf3Q07104 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms