Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms