Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai1Q02085 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms