Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Top2aQ01320 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms