Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms