Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms