Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms