Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms