Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms