Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nbr1P97432 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nbr1P97432 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nbr1P97432 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nbr1P97432 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nbr1P97432 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nbr1P97432 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nbr1P97432 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nbr1P97432 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nbr1P97432 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nbr1P97432 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nbr1P97432 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nbr1P97432 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nbr1P97432 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nbr1P97432 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nbr1P97432 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nbr1P97432 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nbr1P97432 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nbr1P97432 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nbr1P97432 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nbr1P97432 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Nbr1P97432 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nbr1P97432 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nbr1P97432 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nbr1P97432 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nbr1P97432 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nbr1P97432 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nbr1P97432 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nbr1P97432 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nbr1P97432 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nbr1P97432 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nbr1P97432 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms