Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mesp1P97309 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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