Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Irx1P81068 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms