Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms