Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chl1P70232 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chl1P70232 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms