Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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