Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Hyal1-201ENSMUST00000010195 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Zbtb37-201ENSMUST00000159250 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Cpsf3-201ENSMUST00000067284 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm42633-201ENSMUST00000198853 2764 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Mpo-201ENSMUST00000020779 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ces5a-201ENSMUST00000077816 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms