Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rps29P62274 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rps29P62274 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms