Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp46P62069 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp46P62069 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp46P62069 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp46P62069 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp46P62069 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp46P62069 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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