Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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