Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms