Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms