Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FusP56959 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FusP56959 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FusP56959 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FusP56959 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FusP56959 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FusP56959 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FusP56959 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FusP56959 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FusP56959 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FusP56959 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FusP56959 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FusP56959 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FusP56959 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms