Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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