Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgd1P52734 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms