Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms