Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sept1P42209 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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