Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms