Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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