Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms