Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms